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Avances Green Lab. Investigación en ADN Ambiental 2019

Avances en la investigación sobre ADN ambiental (diciembre 2019)

En la actual crisis de biodiversidad, existe una urgente necesidad de herramientas eficientes y fiables para documentar la presencia de especies y evaluar las tendencias de sus poblaciones que ayuden a mejorar las estrategias para detener la pérdida de biodiversidad. Recientes avances en las técnicas moleculares han proporcionado una nueva herramienta para la detección del ADN presente en el ambiente o ADN ambiental (eDNA) que puede usarse como base para realizar inventarios taxonómicos y evaluar la distribución de las especies, ayudando a mejorar la monitorización ambiental. Los anfibios en concreto, caracterizados por albergar muchas especies discretas, raras y recientemente extintas, son uno de los taxones más vulnerables a nivel mundial y uno de los grupos que más se podría beneficiar del uso de eDNA para su monitorización ya que la probabilidad de detección mediante métodos tradicionales es a menudo baja para aquellas especies menos abundantes y puede variar enormemente debido a las condiciones ambientales locales.

El Centro de Estudios Ambientales (CEA) ha establecido un convenio de colaboración con el grupo de investigación “Sistemática, Biogeografía, Ecología del comportamiento y Evolución (SBEcE)” de la Universidad del País Vasco, con el Dr. B.J. Gómez-Moliner como investigador responsable, con el objetivo de poner a punto de una metodología de monitorización de las comunidades de anfibios del municipio de Vitoria-Gasteiz mediante la técnica de metabarcoding de ADN ambiental que ayude en la gestión de este grupo de vertebrados. Hasta la fecha el grupo SBEcE ha diseñado un protocolo de recogida de muestras de agua y de sedimento específico para la problemática, mediante el cual se han muestreado 41 masas de agua del municipio de Vitoria-Gasteiz. Estas muestras han sido ya procesadas para extraer su ADN y están a la espera de ser secuenciadas mediante secuenciación masiva a través del Servicio de Genómica de la UPV (Sgiker – UPV/EHU) en la plataforma Illumina. Además, también se ha creado una base de datos de referencia del marcador molecular seleccionado para el estudio, un fragmento de ADN de 60 pares de bases (pb) de la región 12S del ADN mitocondrial, empleando secuencias de ADN obtenidas de bases de datos públicas y generando secuencias nuevas para 59 muestras de tejido de 16 especies de anfibios de la península ibérica. Esta base de datos servirá para determinar si el marcador es suficientemente polimórfico para diferenciar las diferentes especies y para tener una base de datos de referencia sobre la que comparar las secuencias de ADN obtenidas en las muestras ambientales analizadas.

El informe completo se puede consultar aquí:

Informe Green Lab EHU ADN ambiental 2019

 

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